Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF10P55107 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF10P55107 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF10P55107 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF10P55107 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF10P55107 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF10P55107 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF10P55107 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF10P55107 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF10P55107 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF10P55107 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF10P55107 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF10P55107 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF10P55107 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF10P55107 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF10P55107 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF10P55107 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF10P55107 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF10P55107 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF10P55107 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF10P55107 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF10P55107 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF10P55107 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF10P55107 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF10P55107 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF10P55107 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF10P55107 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF10P55107 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF10P55107 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF10P55107 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF10P55107 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF10P55107 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF10P55107 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF10P55107 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF10P55107 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF10P55107 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF10P55107 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF10P55107 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF10P55107 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF10P55107 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF10P55107 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF10P55107 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF10P55107 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF10P55107 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF10P55107 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF10P55107 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF10P55107 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF10P55107 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF10P55107 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF10P55107 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF10P55107 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF10P55107 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF10P55107 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF10P55107 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF10P55107 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF10P55107 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF10P55107 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF10P55107 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GDF10P55107 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF10P55107 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF10P55107 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF10P55107 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF10P55107 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF10P55107 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GDF10P55107 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF10P55107 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF10P55107 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF10P55107 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF10P55107 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF10P55107 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF10P55107 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF10P55107 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF10P55107 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF10P55107 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF10P55107 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF10P55107 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GDF10P55107 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF10P55107 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF10P55107 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF10P55107 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF10P55107 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF10P55107 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF10P55107 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF10P55107 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF10P55107 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF10P55107 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF10P55107 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF10P55107 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF10P55107 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF10P55107 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF10P55107 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF10P55107 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF10P55107 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GDF10P55107 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF10P55107 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF10P55107 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF10P55107 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF10P55107 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF10P55107 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GDF10P55107 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms