Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC12A2P55011 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC12A2P55011 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms