Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LIMK2P53671 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LIMK2P53671 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms