Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOSBP53539 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FOSBP53539 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FOSBP53539 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FOSBP53539 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FOSBP53539 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOSBP53539 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOSBP53539 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOSBP53539 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOSBP53539 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FOSBP53539 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOSBP53539 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOSBP53539 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOSBP53539 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
FOSBP53539 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOSBP53539 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOSBP53539 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOSBP53539 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOSBP53539 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOSBP53539 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOSBP53539 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FOSBP53539 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOSBP53539 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FOSBP53539 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOSBP53539 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOSBP53539 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOSBP53539 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOSBP53539 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOSBP53539 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOSBP53539 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOSBP53539 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOSBP53539 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOSBP53539 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOSBP53539 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOSBP53539 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOSBP53539 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOSBP53539 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FOSBP53539 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOSBP53539 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOSBP53539 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOSBP53539 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOSBP53539 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOSBP53539 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOSBP53539 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOSBP53539 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOSBP53539 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOSBP53539 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOSBP53539 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOSBP53539 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOSBP53539 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOSBP53539 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOSBP53539 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOSBP53539 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOSBP53539 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOSBP53539 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOSBP53539 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOSBP53539 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOSBP53539 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FOSBP53539 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOSBP53539 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FOSBP53539 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOSBP53539 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOSBP53539 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOSBP53539 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOSBP53539 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOSBP53539 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOSBP53539 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOSBP53539 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOSBP53539 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOSBP53539 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOSBP53539 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FOSBP53539 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOSBP53539 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOSBP53539 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOSBP53539 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOSBP53539 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOSBP53539 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOSBP53539 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOSBP53539 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOSBP53539 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOSBP53539 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOSBP53539 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOSBP53539 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOSBP53539 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOSBP53539 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOSBP53539 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOSBP53539 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOSBP53539 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOSBP53539 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOSBP53539 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FOSBP53539 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FOSBP53539 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOSBP53539 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOSBP53539 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOSBP53539 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOSBP53539 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOSBP53539 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOSBP53539 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOSBP53539 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOSBP53539 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms