Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.99
SMARCA4P51532 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
SMARCA4P51532 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
SMARCA4P51532 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
SMARCA4P51532 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
SMARCA4P51532 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
SMARCA4P51532 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
SMARCA4P51532 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
SMARCA4P51532 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
SMARCA4P51532 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
SMARCA4P51532 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
SMARCA4P51532 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
SMARCA4P51532 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
SMARCA4P51532 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
SMARCA4P51532 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
SMARCA4P51532 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
SMARCA4P51532 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
SMARCA4P51532 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
SMARCA4P51532 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
SMARCA4P51532 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
SMARCA4P51532 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
SMARCA4P51532 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
SMARCA4P51532 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
SMARCA4P51532 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
SMARCA4P51532 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
SMARCA4P51532 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
SMARCA4P51532 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
SMARCA4P51532 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
SMARCA4P51532 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
SMARCA4P51532 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC39.88■■■■□ 3.98
SMARCA4P51532 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC39.83■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
SMARCA4P51532 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.96
SMARCA4P51532 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
SMARCA4P51532 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
SMARCA4P51532 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
SMARCA4P51532 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
SMARCA4P51532 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
SMARCA4P51532 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
SMARCA4P51532 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
SMARCA4P51532 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
SMARCA4P51532 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
SMARCA4P51532 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
SMARCA4P51532 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
SMARCA4P51532 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
SMARCA4P51532 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
SMARCA4P51532 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC39.79■■■■□ 3.96
SMARCA4P51532 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
SMARCA4P51532 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
SMARCA4P51532 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms