Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCNN1GP51170 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCNN1GP51170 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCNN1GP51170 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms