Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RGS4P49798 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RGS4P49798 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RGS4P49798 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGS4P49798 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGS4P49798 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGS4P49798 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGS4P49798 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGS4P49798 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGS4P49798 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGS4P49798 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RGS4P49798 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RGS4P49798 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGS4P49798 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RGS4P49798 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGS4P49798 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGS4P49798 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RGS4P49798 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGS4P49798 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGS4P49798 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGS4P49798 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGS4P49798 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGS4P49798 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGS4P49798 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGS4P49798 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGS4P49798 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGS4P49798 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGS4P49798 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGS4P49798 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RGS4P49798 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RGS4P49798 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RGS4P49798 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGS4P49798 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGS4P49798 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGS4P49798 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGS4P49798 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGS4P49798 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGS4P49798 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGS4P49798 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGS4P49798 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGS4P49798 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGS4P49798 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RGS4P49798 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGS4P49798 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGS4P49798 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RGS4P49798 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGS4P49798 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RGS4P49798 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGS4P49798 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGS4P49798 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGS4P49798 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGS4P49798 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGS4P49798 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RGS4P49798 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGS4P49798 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGS4P49798 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGS4P49798 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGS4P49798 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGS4P49798 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGS4P49798 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGS4P49798 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGS4P49798 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGS4P49798 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGS4P49798 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGS4P49798 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RGS4P49798 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGS4P49798 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGS4P49798 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGS4P49798 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGS4P49798 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGS4P49798 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGS4P49798 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGS4P49798 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGS4P49798 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGS4P49798 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RGS4P49798 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RGS4P49798 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RGS4P49798 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGS4P49798 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGS4P49798 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGS4P49798 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGS4P49798 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGS4P49798 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RGS4P49798 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RGS4P49798 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGS4P49798 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGS4P49798 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGS4P49798 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGS4P49798 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGS4P49798 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGS4P49798 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGS4P49798 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGS4P49798 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGS4P49798 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGS4P49798 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGS4P49798 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RGS4P49798 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGS4P49798 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RGS4P49798 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RGS4P49798 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms