Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSR1P43307 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSR1P43307 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SSR1P43307 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSR1P43307 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSR1P43307 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSR1P43307 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSR1P43307 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SSR1P43307 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSR1P43307 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSR1P43307 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SSR1P43307 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSR1P43307 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSR1P43307 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SSR1P43307 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSR1P43307 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSR1P43307 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSR1P43307 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSR1P43307 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSR1P43307 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSR1P43307 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSR1P43307 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSR1P43307 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSR1P43307 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSR1P43307 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSR1P43307 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSR1P43307 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSR1P43307 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSR1P43307 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSR1P43307 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SSR1P43307 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSR1P43307 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSR1P43307 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SSR1P43307 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSR1P43307 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSR1P43307 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSR1P43307 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSR1P43307 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSR1P43307 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSR1P43307 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSR1P43307 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSR1P43307 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSR1P43307 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SSR1P43307 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSR1P43307 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSR1P43307 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSR1P43307 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSR1P43307 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSR1P43307 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSR1P43307 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSR1P43307 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSR1P43307 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSR1P43307 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSR1P43307 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSR1P43307 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSR1P43307 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSR1P43307 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSR1P43307 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSR1P43307 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSR1P43307 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSR1P43307 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSR1P43307 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSR1P43307 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSR1P43307 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SSR1P43307 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSR1P43307 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSR1P43307 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSR1P43307 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSR1P43307 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSR1P43307 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSR1P43307 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSR1P43307 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSR1P43307 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSR1P43307 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSR1P43307 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSR1P43307 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSR1P43307 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSR1P43307 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SSR1P43307 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSR1P43307 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSR1P43307 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSR1P43307 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSR1P43307 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSR1P43307 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSR1P43307 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SSR1P43307 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSR1P43307 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSR1P43307 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSR1P43307 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSR1P43307 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SSR1P43307 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSR1P43307 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSR1P43307 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSR1P43307 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSR1P43307 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSR1P43307 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSR1P43307 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSR1P43307 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSR1P43307 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SSR1P43307 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms