Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA1P42261 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms