Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX11P35716 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX11P35716 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX11P35716 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX11P35716 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX11P35716 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX11P35716 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX11P35716 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX11P35716 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX11P35716 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX11P35716 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX11P35716 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX11P35716 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX11P35716 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX11P35716 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX11P35716 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX11P35716 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX11P35716 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX11P35716 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX11P35716 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX11P35716 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX11P35716 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX11P35716 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX11P35716 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX11P35716 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX11P35716 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX11P35716 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX11P35716 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX11P35716 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX11P35716 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX11P35716 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX11P35716 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX11P35716 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX11P35716 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX11P35716 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX11P35716 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX11P35716 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX11P35716 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX11P35716 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX11P35716 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX11P35716 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX11P35716 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOX11P35716 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOX11P35716 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOX11P35716 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOX11P35716 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOX11P35716 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOX11P35716 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOX11P35716 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOX11P35716 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOX11P35716 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOX11P35716 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SOX11P35716 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOX11P35716 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOX11P35716 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOX11P35716 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SOX11P35716 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX11P35716 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX11P35716 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX11P35716 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX11P35716 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX11P35716 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX11P35716 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX11P35716 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX11P35716 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX11P35716 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX11P35716 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX11P35716 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX11P35716 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX11P35716 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX11P35716 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX11P35716 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX11P35716 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX11P35716 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX11P35716 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SOX11P35716 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SOX11P35716 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SOX11P35716 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOX11P35716 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOX11P35716 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOX11P35716 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOX11P35716 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOX11P35716 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOX11P35716 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOX11P35716 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOX11P35716 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SOX11P35716 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOX11P35716 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOX11P35716 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOX11P35716 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOX11P35716 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOX11P35716 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOX11P35716 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOX11P35716 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOX11P35716 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SOX11P35716 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOX11P35716 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOX11P35716 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOX11P35716 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOX11P35716 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms