Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCND3P30281 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCND3P30281 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCND3P30281 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCND3P30281 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCND3P30281 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCND3P30281 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCND3P30281 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCND3P30281 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCND3P30281 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCND3P30281 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCND3P30281 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCND3P30281 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCND3P30281 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCND3P30281 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCND3P30281 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCND3P30281 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCND3P30281 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCND3P30281 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCND3P30281 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCND3P30281 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCND3P30281 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCND3P30281 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCND3P30281 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCND3P30281 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCND3P30281 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCND3P30281 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCND3P30281 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCND3P30281 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCND3P30281 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCND3P30281 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCND3P30281 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCND3P30281 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCND3P30281 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCND3P30281 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCND3P30281 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCND3P30281 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCND3P30281 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCND3P30281 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCND3P30281 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCND3P30281 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCND3P30281 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCND3P30281 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCND3P30281 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCND3P30281 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCND3P30281 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCND3P30281 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCND3P30281 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCND3P30281 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCND3P30281 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCND3P30281 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCND3P30281 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCND3P30281 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCND3P30281 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCND3P30281 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCND3P30281 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCND3P30281 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCND3P30281 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCND3P30281 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCND3P30281 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCND3P30281 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCND3P30281 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCND3P30281 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCND3P30281 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCND3P30281 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCND3P30281 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCND3P30281 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCND3P30281 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCND3P30281 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCND3P30281 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCND3P30281 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCND3P30281 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCND3P30281 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCND3P30281 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCND3P30281 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCND3P30281 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCND3P30281 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCND3P30281 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCND3P30281 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCND3P30281 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCND3P30281 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCND3P30281 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCND3P30281 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCND3P30281 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCND3P30281 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCND3P30281 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCND3P30281 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCND3P30281 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCND3P30281 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCND3P30281 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCND3P30281 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCND3P30281 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCND3P30281 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCND3P30281 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCND3P30281 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCND3P30281 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCND3P30281 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCND3P30281 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCND3P30281 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCND3P30281 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms