Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTGFP29279 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTGFP29279 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTGFP29279 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTGFP29279 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTGFP29279 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTGFP29279 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTGFP29279 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTGFP29279 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTGFP29279 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTGFP29279 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTGFP29279 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTGFP29279 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTGFP29279 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CTGFP29279 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTGFP29279 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTGFP29279 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTGFP29279 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTGFP29279 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTGFP29279 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CTGFP29279 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CTGFP29279 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CTGFP29279 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTGFP29279 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTGFP29279 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTGFP29279 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTGFP29279 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTGFP29279 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTGFP29279 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTGFP29279 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTGFP29279 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTGFP29279 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTGFP29279 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTGFP29279 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTGFP29279 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTGFP29279 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTGFP29279 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTGFP29279 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CTGFP29279 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CTGFP29279 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTGFP29279 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CTGFP29279 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTGFP29279 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTGFP29279 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTGFP29279 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTGFP29279 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CTGFP29279 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTGFP29279 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTGFP29279 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTGFP29279 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTGFP29279 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTGFP29279 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTGFP29279 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTGFP29279 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTGFP29279 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTGFP29279 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTGFP29279 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTGFP29279 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTGFP29279 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CTGFP29279 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTGFP29279 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTGFP29279 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTGFP29279 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CTGFP29279 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTGFP29279 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTGFP29279 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTGFP29279 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTGFP29279 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTGFP29279 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTGFP29279 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTGFP29279 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTGFP29279 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTGFP29279 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTGFP29279 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTGFP29279 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTGFP29279 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTGFP29279 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTGFP29279 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTGFP29279 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTGFP29279 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTGFP29279 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTGFP29279 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTGFP29279 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTGFP29279 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTGFP29279 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTGFP29279 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTGFP29279 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTGFP29279 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTGFP29279 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTGFP29279 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTGFP29279 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTGFP29279 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTGFP29279 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTGFP29279 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CTGFP29279 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTGFP29279 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTGFP29279 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTGFP29279 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CTGFP29279 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTGFP29279 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms