Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms