Protein–RNA interactions for Protein: P21580

TNFAIP3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP3P21580 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNFAIP3P21580 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFAIP3P21580 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms