Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNNI1P19237 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNI1P19237 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNI1P19237 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms