Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN8P19075 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN8P19075 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN8P19075 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN8P19075 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN8P19075 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN8P19075 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN8P19075 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN8P19075 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN8P19075 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN8P19075 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN8P19075 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN8P19075 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN8P19075 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN8P19075 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN8P19075 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN8P19075 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN8P19075 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN8P19075 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN8P19075 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN8P19075 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN8P19075 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN8P19075 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN8P19075 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN8P19075 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN8P19075 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN8P19075 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSPAN8P19075 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TSPAN8P19075 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSPAN8P19075 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN8P19075 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms