Protein–RNA interactions for Protein: P13804

ETFA, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFAP13804 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETFAP13804 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETFAP13804 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETFAP13804 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETFAP13804 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETFAP13804 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETFAP13804 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETFAP13804 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ETFAP13804 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ETFAP13804 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ETFAP13804 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFAP13804 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFAP13804 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFAP13804 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFAP13804 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFAP13804 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFAP13804 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFAP13804 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFAP13804 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFAP13804 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFAP13804 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFAP13804 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFAP13804 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFAP13804 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFAP13804 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFAP13804 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFAP13804 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFAP13804 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFAP13804 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFAP13804 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFAP13804 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFAP13804 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFAP13804 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFAP13804 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFAP13804 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFAP13804 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFAP13804 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFAP13804 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFAP13804 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFAP13804 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFAP13804 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFAP13804 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFAP13804 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFAP13804 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFAP13804 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFAP13804 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFAP13804 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFAP13804 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFAP13804 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFAP13804 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFAP13804 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFAP13804 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFAP13804 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETFAP13804 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETFAP13804 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETFAP13804 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETFAP13804 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETFAP13804 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETFAP13804 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETFAP13804 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETFAP13804 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETFAP13804 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETFAP13804 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETFAP13804 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETFAP13804 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETFAP13804 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETFAP13804 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETFAP13804 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETFAP13804 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETFAP13804 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ETFAP13804 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ETFAP13804 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ETFAP13804 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ETFAP13804 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETFAP13804 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETFAP13804 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETFAP13804 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ETFAP13804 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ETFAP13804 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ETFAP13804 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ETFAP13804 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ETFAP13804 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ETFAP13804 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ETFAP13804 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ETFAP13804 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ETFAP13804 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ETFAP13804 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ETFAP13804 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ETFAP13804 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ETFAP13804 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ETFAP13804 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ETFAP13804 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ETFAP13804 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ETFAP13804 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETFAP13804 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETFAP13804 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETFAP13804 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETFAP13804 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETFAP13804 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ETFAP13804 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms