Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MS4A1P11836 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MS4A1P11836 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms