Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC166P0CW27 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC166P0CW27 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms