Protein–RNA interactions for Protein: P0C7P4

UQCRFS1P1, Putative cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRFS1P1P0C7P4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UQCRFS1P1P0C7P4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UQCRFS1P1P0C7P4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms