Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSLP07711 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSLP07711 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSLP07711 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSLP07711 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSLP07711 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSLP07711 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSLP07711 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSLP07711 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSLP07711 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSLP07711 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSLP07711 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSLP07711 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSLP07711 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSLP07711 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSLP07711 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSLP07711 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSLP07711 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSLP07711 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSLP07711 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSLP07711 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSLP07711 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSLP07711 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSLP07711 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSLP07711 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSLP07711 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSLP07711 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSLP07711 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSLP07711 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSLP07711 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSLP07711 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSLP07711 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSLP07711 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSLP07711 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSLP07711 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSLP07711 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSLP07711 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSLP07711 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSLP07711 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSLP07711 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSLP07711 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSLP07711 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSLP07711 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSLP07711 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSLP07711 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSLP07711 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSLP07711 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSLP07711 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSLP07711 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSLP07711 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSLP07711 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSLP07711 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSLP07711 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSLP07711 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSLP07711 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSLP07711 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSLP07711 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSLP07711 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSLP07711 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSLP07711 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSLP07711 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSLP07711 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTSLP07711 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTSLP07711 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSLP07711 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSLP07711 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSLP07711 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSLP07711 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSLP07711 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSLP07711 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSLP07711 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSLP07711 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSLP07711 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSLP07711 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSLP07711 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSLP07711 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSLP07711 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSLP07711 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSLP07711 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSLP07711 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSLP07711 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSLP07711 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSLP07711 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSLP07711 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSLP07711 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSLP07711 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSLP07711 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSLP07711 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSLP07711 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSLP07711 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSLP07711 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSLP07711 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSLP07711 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSLP07711 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSLP07711 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSLP07711 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSLP07711 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSLP07711 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSLP07711 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSLP07711 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms