Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPN1P04843 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RPN1P04843 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPN1P04843 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPN1P04843 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPN1P04843 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPN1P04843 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPN1P04843 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPN1P04843 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPN1P04843 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPN1P04843 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPN1P04843 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPN1P04843 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPN1P04843 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPN1P04843 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPN1P04843 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPN1P04843 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPN1P04843 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPN1P04843 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPN1P04843 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPN1P04843 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPN1P04843 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPN1P04843 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RPN1P04843 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPN1P04843 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPN1P04843 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPN1P04843 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPN1P04843 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPN1P04843 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPN1P04843 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPN1P04843 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPN1P04843 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPN1P04843 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPN1P04843 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPN1P04843 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPN1P04843 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPN1P04843 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RPN1P04843 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RPN1P04843 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RPN1P04843 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RPN1P04843 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RPN1P04843 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPN1P04843 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPN1P04843 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPN1P04843 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPN1P04843 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPN1P04843 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPN1P04843 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPN1P04843 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPN1P04843 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPN1P04843 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPN1P04843 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPN1P04843 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPN1P04843 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPN1P04843 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RPN1P04843 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPN1P04843 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RPN1P04843 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPN1P04843 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPN1P04843 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPN1P04843 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPN1P04843 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPN1P04843 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPN1P04843 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPN1P04843 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPN1P04843 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPN1P04843 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPN1P04843 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPN1P04843 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPN1P04843 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPN1P04843 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPN1P04843 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPN1P04843 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPN1P04843 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPN1P04843 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPN1P04843 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPN1P04843 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPN1P04843 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPN1P04843 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPN1P04843 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPN1P04843 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPN1P04843 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPN1P04843 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPN1P04843 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPN1P04843 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPN1P04843 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPN1P04843 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RPN1P04843 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPN1P04843 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RPN1P04843 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPN1P04843 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPN1P04843 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPN1P04843 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPN1P04843 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPN1P04843 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPN1P04843 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPN1P04843 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPN1P04843 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPN1P04843 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPN1P04843 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms