Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYCNP04198 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYCNP04198 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYCNP04198 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYCNP04198 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MYCNP04198 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MYCNP04198 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYCNP04198 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYCNP04198 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYCNP04198 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYCNP04198 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYCNP04198 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MYCNP04198 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYCNP04198 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYCNP04198 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYCNP04198 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MYCNP04198 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MYCNP04198 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYCNP04198 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYCNP04198 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYCNP04198 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYCNP04198 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYCNP04198 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYCNP04198 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYCNP04198 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYCNP04198 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYCNP04198 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYCNP04198 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYCNP04198 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYCNP04198 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYCNP04198 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYCNP04198 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYCNP04198 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYCNP04198 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
MYCNP04198 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYCNP04198 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MYCNP04198 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYCNP04198 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYCNP04198 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYCNP04198 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYCNP04198 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYCNP04198 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYCNP04198 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYCNP04198 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MYCNP04198 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MYCNP04198 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYCNP04198 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYCNP04198 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYCNP04198 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYCNP04198 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYCNP04198 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYCNP04198 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYCNP04198 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYCNP04198 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYCNP04198 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYCNP04198 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MYCNP04198 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYCNP04198 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYCNP04198 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYCNP04198 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYCNP04198 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYCNP04198 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYCNP04198 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYCNP04198 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYCNP04198 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYCNP04198 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYCNP04198 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYCNP04198 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYCNP04198 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYCNP04198 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYCNP04198 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYCNP04198 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYCNP04198 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYCNP04198 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYCNP04198 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYCNP04198 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYCNP04198 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYCNP04198 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYCNP04198 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MYCNP04198 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MYCNP04198 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYCNP04198 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYCNP04198 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYCNP04198 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYCNP04198 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYCNP04198 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYCNP04198 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYCNP04198 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYCNP04198 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYCNP04198 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYCNP04198 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYCNP04198 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYCNP04198 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYCNP04198 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYCNP04198 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYCNP04198 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYCNP04198 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYCNP04198 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYCNP04198 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYCNP04198 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms