Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIMP1P01033 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIMP1P01033 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms