Protein–RNA interactions for Protein: O94886

TMEM63A, CSC1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM63AO94886 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM63AO94886 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM63AO94886 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM63AO94886 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms