Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SLIT2O94813 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms