Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPS6KA4O75676 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPS6KA4O75676 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPS6KA4O75676 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms