Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAB11FIP3O75154 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms