Protein–RNA interactions for Protein: O60522

TDRD6, Tudor domain-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,096 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD6O60522 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD6O60522 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD6O60522 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD6O60522 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD6O60522 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD6O60522 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD6O60522 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD6O60522 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRD6O60522 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD6O60522 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD6O60522 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD6O60522 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD6O60522 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD6O60522 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRD6O60522 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD6O60522 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD6O60522 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD6O60522 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD6O60522 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD6O60522 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD6O60522 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD6O60522 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TDRD6O60522 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TDRD6O60522 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TDRD6O60522 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TDRD6O60522 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRD6O60522 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms