Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC35.1■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
KIAA0556O60303 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
KIAA0556O60303 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
KIAA0556O60303 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms