Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYNGR3O43761 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms