Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKAB2O43741 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKAB2O43741 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms