Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DENRO43583 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DENRO43583 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DENRO43583 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DENRO43583 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DENRO43583 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DENRO43583 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DENRO43583 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DENRO43583 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DENRO43583 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DENRO43583 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DENRO43583 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DENRO43583 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DENRO43583 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DENRO43583 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DENRO43583 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DENRO43583 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DENRO43583 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DENRO43583 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DENRO43583 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DENRO43583 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DENRO43583 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DENRO43583 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DENRO43583 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DENRO43583 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DENRO43583 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DENRO43583 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DENRO43583 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DENRO43583 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DENRO43583 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
DENRO43583 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DENRO43583 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DENRO43583 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DENRO43583 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DENRO43583 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DENRO43583 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DENRO43583 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DENRO43583 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DENRO43583 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DENRO43583 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DENRO43583 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DENRO43583 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DENRO43583 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DENRO43583 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DENRO43583 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DENRO43583 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DENRO43583 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DENRO43583 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DENRO43583 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DENRO43583 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DENRO43583 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DENRO43583 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DENRO43583 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DENRO43583 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DENRO43583 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DENRO43583 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DENRO43583 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DENRO43583 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DENRO43583 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DENRO43583 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DENRO43583 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DENRO43583 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DENRO43583 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DENRO43583 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DENRO43583 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DENRO43583 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DENRO43583 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DENRO43583 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DENRO43583 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DENRO43583 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DENRO43583 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DENRO43583 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DENRO43583 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DENRO43583 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DENRO43583 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DENRO43583 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DENRO43583 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DENRO43583 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DENRO43583 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DENRO43583 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DENRO43583 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DENRO43583 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DENRO43583 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DENRO43583 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DENRO43583 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DENRO43583 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DENRO43583 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DENRO43583 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DENRO43583 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DENRO43583 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DENRO43583 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DENRO43583 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DENRO43583 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DENRO43583 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DENRO43583 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DENRO43583 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DENRO43583 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DENRO43583 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DENRO43583 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DENRO43583 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms