Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF3O43395 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF3O43395 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms