Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EPHB6O15197 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms