Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR1CO15160 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR1CO15160 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
POLR1CO15160 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR1CO15160 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR1CO15160 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR1CO15160 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR1CO15160 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR1CO15160 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR1CO15160 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR1CO15160 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR1CO15160 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR1CO15160 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR1CO15160 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR1CO15160 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR1CO15160 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR1CO15160 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR1CO15160 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR1CO15160 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR1CO15160 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR1CO15160 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms