Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SYNMO15061 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SYNMO15061 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SYNMO15061 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SYNMO15061 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SYNMO15061 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SYNMO15061 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SYNMO15061 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SYNMO15061 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SYNMO15061 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SYNMO15061 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SYNMO15061 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SYNMO15061 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
SYNMO15061 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
SYNMO15061 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SYNMO15061 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SYNMO15061 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SYNMO15061 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SYNMO15061 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SYNMO15061 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
SYNMO15061 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SYNMO15061 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SYNMO15061 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SYNMO15061 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SYNMO15061 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SYNMO15061 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SYNMO15061 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SYNMO15061 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SYNMO15061 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SYNMO15061 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SYNMO15061 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SYNMO15061 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SYNMO15061 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SYNMO15061 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SYNMO15061 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SYNMO15061 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SYNMO15061 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SYNMO15061 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SYNMO15061 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SYNMO15061 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SYNMO15061 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SYNMO15061 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SYNMO15061 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SYNMO15061 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SYNMO15061 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SYNMO15061 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SYNMO15061 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SYNMO15061 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SYNMO15061 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SYNMO15061 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
SYNMO15061 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SYNMO15061 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SYNMO15061 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SYNMO15061 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
SYNMO15061 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SYNMO15061 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SYNMO15061 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SYNMO15061 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SYNMO15061 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SYNMO15061 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SYNMO15061 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SYNMO15061 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SYNMO15061 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
SYNMO15061 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
SYNMO15061 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SYNMO15061 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SYNMO15061 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SYNMO15061 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SYNMO15061 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
SYNMO15061 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SYNMO15061 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SYNMO15061 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SYNMO15061 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SYNMO15061 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SYNMO15061 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SYNMO15061 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
SYNMO15061 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
SYNMO15061 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SYNMO15061 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
SYNMO15061 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SYNMO15061 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SYNMO15061 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SYNMO15061 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SYNMO15061 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SYNMO15061 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SYNMO15061 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SYNMO15061 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SYNMO15061 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SYNMO15061 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
SYNMO15061 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SYNMO15061 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SYNMO15061 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SYNMO15061 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SYNMO15061 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SYNMO15061 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SYNMO15061 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SYNMO15061 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SYNMO15061 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SYNMO15061 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SYNMO15061 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms