Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BQV1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BQV1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BQV1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BQV1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BQV1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BQV1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BQV1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BQV1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BQV1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BQV1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BQV1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BQV1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BQV1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BQV1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BQV1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BQV1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BQV1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BQV1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BQV1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BQV1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BQV1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BQV1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BQV1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BQV1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BQV1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BQV1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BQV1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BQV1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BQV1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BQV1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BQV1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BQV1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BQV1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BQV1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BQV1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BQV1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BQV1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BQV1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BQV1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BQV1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BQV1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BQV1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
H3BQV1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
H3BQV1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
H3BQV1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
H3BQV1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BQV1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BQV1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BQV1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BQV1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BQV1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BQV1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BQV1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BQV1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BQV1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BQV1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BQV1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H3BQV1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H3BQV1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H3BQV1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H3BQV1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H3BQV1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H3BQV1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H3BQV1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H3BQV1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BQV1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BQV1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BQV1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BQV1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BQV1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BQV1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BQV1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BQV1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BQV1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BQV1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BQV1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BQV1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BQV1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BQV1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BQV1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BQV1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BQV1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BQV1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BQV1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BQV1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BQV1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BQV1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BQV1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BQV1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BQV1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H3BQV1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H3BQV1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H3BQV1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H3BQV1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H3BQV1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H3BQV1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H3BQV1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H3BQV1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H3BQV1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms