Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.11
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms