Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf47A7E2U8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4orf47A7E2U8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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