Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
VPS37CA5D8V6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VPS37CA5D8V6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VPS37CA5D8V6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms