Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0D9SFI3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
A0A0D9SFI3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0D9SFI3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0D9SFI3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0D9SFI3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0D9SFI3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0D9SFI3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0D9SFI3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0D9SFI3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0D9SFI3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0D9SFI3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0D9SFI3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0D9SFI3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0D9SFI3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0D9SFI3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0D9SFI3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A0D9SFI3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A0D9SFI3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A0D9SFI3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A0D9SFI3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A0D9SFI3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A0D9SFI3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A0D9SFI3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms