| PTPRJ | Q12913 | DNAJC3-AS1-201 | ENST00000499499 | 2908 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.9 | □□□□□ -0.18 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ZNF395-201 | ENST00000344423 | 4808 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.9 | □□□□□ -0.18 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SLC35D1-201 | ENST00000235345 | 6162 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.9 | □□□□□ -0.18 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CDK7-201 | ENST00000256443 | 1439 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.9 | □□□□□ -0.18 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SMIM27-203 | ENST00000451672 | 2382 nt | APPRIS ALT2 BASIC | 13.9 | □□□□□ -0.18 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RABGAP1L-207 | ENST00000367690 | 1815 nt | TSL 2 BASIC | 13.9 | □□□□□ -0.18 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ZNF114-201 | ENST00000315849 | 2206 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 13.9 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SLURP1-201 | ENST00000246515 | 537 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.9 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RNF181-201 | ENST00000306368 | 569 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 13.9 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ARPC5-203 | ENST00000367534 | 622 nt | TSL 3 BASIC | 13.9 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SLC35A2-203 | ENST00000376515 | 1044 nt | TSL 3 BASIC | 13.9 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GAPDHP67-201 | ENST00000422905 | 788 nt | BASIC | 13.9 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RNF181-203 | ENST00000441634 | 844 nt | APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC | 13.9 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | APCDD1L-AS1-206 | ENST00000445984 | 566 nt | TSL 3 BASIC | 13.9 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | APCDD1L-AS1-208 | ENST00000448374 | 546 nt | TSL 4 BASIC | 13.9 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL353653.1-201 | ENST00000452336 | 638 nt | TSL 2 BASIC | 13.9 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TREX1-203 | ENST00000456089 | 629 nt | TSL 3 BASIC | 13.9 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AP000533.1-201 | ENST00000456143 | 1177 nt | BASIC | 13.9 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC113340.1-201 | ENST00000475257 | 636 nt | BASIC | 13.9 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RPL30P11-202 | ENST00000509114 | 358 nt | TSL 3 BASIC | 13.9 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HNRNPA1P7-201 | ENST00000521273 | 963 nt | BASIC | 13.9 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TIMM10-202 | ENST00000525158 | 530 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 13.9 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC108471.2-201 | ENST00000533736 | 1061 nt | TSL 3 BASIC | 13.9 | □□□□□ -0.19 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | AL391832.3-201 | ENST00000549744 | 846 nt | TSL 3 BASIC | 13.9 | □□□□□ -0.19 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | AC005746.3-201 | ENST00000614751 | 393 nt | BASIC | 13.9 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AP000357.2-201 | ENST00000633827 | 597 nt | TSL 2 BASIC | 13.9 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GRB10-202 | ENST00000357271 | 2050 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FAM90A26-201 | ENST00000512047 | 2492 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | HTR2C-203 | ENST00000371951 | 3288 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PES1-205 | ENST00000405677 | 2708 nt | TSL 2 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RUNX2-AS1-201 | ENST00000563807 | 1513 nt | TSL 5 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SPG11-210 | ENST00000558319 | 6426 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SFPQP1-201 | ENST00000446621 | 1786 nt | BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TNS2-202 | ENST00000314276 | 4944 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FAM170A-206 | ENST00000613773 | 1374 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SLC1A1-201 | ENST00000262352 | 3722 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NNMT-203 | ENST00000535401 | 1867 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SMUG1-AS1-201 | ENST00000634796 | 1734 nt | TSL 5 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PIK3R1-213 | ENST00000521657 | 3891 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | RIPOR3-202 | ENST00000327979 | 4377 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CAPN1-202 | ENST00000524773 | 2960 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | KCNH1-205 | ENST00000638498 | 3479 nt | TSL 5 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ENPP7P8-202 | ENST00000527856 | 1345 nt | BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NKIRAS2-205 | ENST00000393881 | 1598 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PAWR-201 | ENST00000328827 | 9129 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | FAS-204 | ENST00000355740 | 2563 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CCDC112-201 | ENST00000379611 | 2566 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | UBE2L3-204 | ENST00000545681 | 2932 nt | TSL 2 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ABCC4-207 | ENST00000629385 | 2903 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | KCTD7-201 | ENST00000275532 | 4795 nt | TSL 4 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AL135960.1-201 | ENST00000422216 | 4036 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | C17orf53-203 | ENST00000585683 | 2529 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CREB3L4-203 | ENST00000368601 | 950 nt | TSL 2 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC019349.1-201 | ENST00000411759 | 476 nt | TSL 3 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | AC008676.2-201 | ENST00000519499 | 741 nt | TSL 3 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LINC00824-204 | ENST00000520766 | 597 nt | TSL 5 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | C8orf37-AS1-203 | ENST00000521905 | 617 nt | TSL 5 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | IGHV3OR15-7-201 | ENST00000558565 | 359 nt | APPRIS P1 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MIR5001-201 | ENST00000580185 | 100 nt | BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | AC100788.1-201 | ENST00000591108 | 945 nt | TSL 5 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
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| PTPRJ | Q12913 | FXYD3-211 | ENST00000604804 | 564 nt | TSL 4 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SNX20-205 | ENST00000610485 | 557 nt | TSL 5 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | MCM8-AS1-201 | ENST00000613522 | 983 nt | TSL 2 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SERPING1-213 | ENST00000619430 | 634 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NRXN1-207 | ENST00000404971 | 7578 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AP1B1-202 | ENST00000357586 | 4176 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PPP2R1A-201 | ENST00000322088 | 5380 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PRAME-201 | ENST00000398741 | 2202 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | STRA6-222 | ENST00000616000 | 2843 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NDUFB11-202 | ENST00000377811 | 1388 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | TRIM37-202 | ENST00000393065 | 3548 nt | TSL 2 BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CPT1C-203 | ENST00000392518 | 2910 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | IGF2BP2-203 | ENST00000421047 | 1711 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LINC02202-201 | ENST00000499583 | 2664 nt | TSL 2 BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ZFAND3-203 | ENST00000373391 | 3001 nt | TSL 5 BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CDC45-205 | ENST00000437685 | 2072 nt | TSL 2 BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GJB1-202 | ENST00000374022 | 1904 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ZNF302-203 | ENST00000457781 | 2600 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | GOLGA6L7P-201 | ENST00000567390 | 2397 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | IP6K2-211 | ENST00000432678 | 1309 nt | TSL 2 BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC116903.2-201 | ENST00000561674 | 1304 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ORMDL2-201 | ENST00000243045 | 2141 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ELAVL1-201 | ENST00000407627 | 6015 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | SUGP2-215 | ENST00000601879 | 5546 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | ATP2B3-201 | ENST00000263519 | 6420 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | LINC00355-201 | ENST00000456627 | 1878 nt | TSL 2 BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | DPYSL2-204 | ENST00000521913 | 4805 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | KCTD21-AS1-207 | ENST00000600795 | 1549 nt | BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | PHB-214 | ENST00000614445 | 1952 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | NACC2-202 | ENST00000371753 | 6802 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | BVES-201 | ENST00000314641 | 5567 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | CLEC17A-203 | ENST00000547437 | 2065 nt | TSL 2 BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC092028.1-202 | ENST00000641483 | 3547 nt | BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| PTPRJ | Q12913 | AC092028.1-201 | ENST00000641781 | 3540 nt | BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |