Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X4

NR2E3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E3Q9Y5X4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR2E3Q9Y5X4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms