Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNX10Q9Y5X0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms