Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAF6Q9Y4K3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAF6Q9Y4K3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms