Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
RAD54L2Q9Y4B4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
RAD54L2Q9Y4B4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
RAD54L2Q9Y4B4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
RAD54L2Q9Y4B4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
RAD54L2Q9Y4B4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
RAD54L2Q9Y4B4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
RAD54L2Q9Y4B4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
RAD54L2Q9Y4B4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
RAD54L2Q9Y4B4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
RAD54L2Q9Y4B4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
RAD54L2Q9Y4B4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
RAD54L2Q9Y4B4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RAD54L2Q9Y4B4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
RAD54L2Q9Y4B4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
RAD54L2Q9Y4B4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
RAD54L2Q9Y4B4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC37.14■■■■□ 3.54
RAD54L2Q9Y4B4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
RAD54L2Q9Y4B4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RAD54L2Q9Y4B4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RAD54L2Q9Y4B4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
RAD54L2Q9Y4B4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
RAD54L2Q9Y4B4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC37.13■■■■□ 3.54
RAD54L2Q9Y4B4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC37.13■■■■□ 3.54
RAD54L2Q9Y4B4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
RAD54L2Q9Y4B4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
RAD54L2Q9Y4B4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms