Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms