Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AMFRQ9UKV5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms