Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN16Q9UKR8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms